Cấu trúc của lò phản ứng IC được đặc trưng bởi tỷ lệ đường kính chiều cao lớn, thường lên đến 4 -, 8, và chiều cao của lò phản ứng đạt 20 trái m phải.Toàn bộ lò phản ứng được cấu tạo bởi một ngăn phản ứng kỵ khí thứ nhất và một ngăn phản ứng kỵ khí thứ hai.Một bộ phân tách ba pha khí, rắn và lỏng được đặt ở trên cùng của mỗi ngăn phản ứng kỵ khí.Thiết bị tách ba pha giai đoạn đầu chủ yếu tách khí sinh học và nước, thiết bị tách ba giai đoạn thứ hai chủ yếu tách bùn và nước, bùn đầu vào và bùn hồi lưu được trộn trong buồng phản ứng kỵ khí thứ nhất.Buồng phản ứng đầu tiên có khả năng loại bỏ chất hữu cơ rất lớn.Nước thải đi vào ngăn phản ứng kỵ khí thứ hai có thể tiếp tục được xử lý để loại bỏ các chất hữu cơ còn lại trong nước thải và nâng cao chất lượng nước thải đầu ra.